Minulý štvrtok sa uskutočnil úspešný demonštračný webinár zameraný na výpočtové inžinierstvo enzýmov, ktorý zaujal široké odborné publikum. Online workshopu sa zúčastnilo približne 40 účastníkov z akademického prostredia aj výskumnej praxe. Podujatie sa uskutočnilo pod záštitou projektu APBC.
Hlavným bodom programu boli odborné prednášky dvoch expertov z University of Groningen – H. J. Wijma a K. T. Korbeld. Vo svojich vystúpeniach sa venovali teoretickým základom stability proteínov a možnostiam jej zlepšovania pomocou moderných inžinierskych prístupov.
Dôraz bol kladený najmä na využitie výpočtových metód, ktoré umožňujú predikovať mutácie vedúce k zvýšeniu (termo)stability cieľových proteínov. Prednášajúci podrobne predstavili dva pokročilé výpočtové protokoly – FRESCO a BoostMut – ktoré boli vyvinuté práve na tento účel. Účastníci získali nielen teoretický prehľad, ale aj praktické odporúčania a tipy na efektívne používanie týchto nástrojov.
Súčasťou workshopu bola aj demonstračná časť, počas ktorej bolo krok za krokom ukázané, ako tieto výpočtové nástroje aplikovať v praxi. Pre oba protokoly sú navyše dostupné podrobné návody prostredníctvom platformy GitHub, čo umožňuje ich využitie širšej komunite výskumníkov s aspoň základnými znalosťami výpočtových metód.
Podujatie tak významne prispelo k šíreniu poznatkov v oblasti racionálneho dizajnu proteínov a podporilo prepojenie teoretických prístupov s praktickým využitím v modernom biochemickom výskume.
