Status partnerská škola udelila Prírodovedecká fakulta UPJŠ v Košiciach tým stredným školám, ktoré sú nositeľmi tvorivého prírodovedného vzdelávania, ktoré sa výraznou mierou zaslúžili o popularizáciu prírodných vied medzi mladými ľuďmi a ktoré dlhodobo s fakultou spolupracujú.
Projekt HoneyLOG vznikol na akademickej pôde Prírodovedeckej fakulty v rámci dizertačnej práce RNDr. JUDr. Pavla Sokola, PhD. Pôvodne študentský projekt bol po prvýkrát prezentovaný na Študentskej vedeckej konferencii PF UPJŠ v roku 2015.
Výučba, ktorá prebiehala v požiarom poškodenej budove sa od pondelka 12. 12. 2016 realizuje náhradným spôsobom. Časť nelaboratórnej výučby bude presunutá do iných priestorov Prírodovedeckej fakulty a Filozofickej fakulty.
Cenu Startup Award Slovakia 2016 v kategórii „Science“ a „Over-all“ získala spoločnosť MultiplexDX. Jedným z dvojice výkonných riaditeľov je absolvent Prírodovedeckej fakulty UPJŠ v Košiciach, Dr. Vladimír Wolf, ktorý ukončil štúdium v odbore Všeobecná biológia v roku 1994.
Na základe návrhu dekana Prírodovedeckej fakulty Univerzity Pavla Jozefa Šafárika v Košiciach a po schválení vo Vedeckej rade Univerzity Pavla Jozefa Šafárika v Košiciach dňa 11.11.2016 bol prof. RNDr. Kataríne Győryovej, DrSc. udelený čestný titul „profesor emeritus“.
Dňa 13. októbra 2016 sa v rámci podujatia Astrofilm 2016, konaného v Piešťanoch, uskutočnilo slávnostné odovzdanie Ceny SAS pri SAV za najlepší populárno-vedecký čin roka 2016. Tohtoročným laureátom sa stal Bc. Jaroslav Merc, študent Prírodovedeckej fakulty UPJŠ v Košiciach.
Dňa 13. októbra 2016 sa v priestoroch Prírodovedeckej fakulty UPJŠ v Košiciach konalo krajské kolo Festivalu vedy a techniky AMAVET - súťažnej prehliadky vedecko-technických projektov žiakov základných a stredných škôl.
Výbor Sekcie pre vedeckú a odbornú literatúru a počítačové programy Literárneho fondu SR na svojom zasadnutí dňa 22.9.2016 udelil prémie za najlepšie práce Študentskej vedeckej konferencie v ak. r. 2015/2016 študentom PF UPJŠ...
Komisia pre Vnútorný vedecký grantový systém Prírodovedeckej fakulty UPJŠ v Košiciach vyhodnotila úspešnosť projektov VVGS PF 2015-2016 mladých vedeckých pracovníkov a doktorandov Prírodovedeckej fakulty UPJŠ v Košiciach, ktorých riešenie bolo ukončené dňa 30. 6. 2016.
Dňa 22. septembra 2016 v Zichyho paláci v Bratislave sa konalo slávnostné odovzdávanieCien a prémií za vedeckú a odbornú literatúru za rok 2015.Prémia za vedeckú a odbornú literatúru za rok 2015 bola udelená aj panidoc. RNDr. Renáte Oriňákovej, DrSc. z Ústavu chemických vied PF UPJŠ.
Dňa 20.9.2016 minister školstva, vedy, výskumu a športu SR vymenoval za jedného z členov Výboru pre spoluprácu SR s CERN RNDr. Mareka Bombaru, PhD., vedeckého pracovníka Ústavu fyzikálnych vied PF UPJŠ.