Názov projektu: Biosyntetické génové klastre antrachinónov: existuje analógia medzi endofytmi a ich hostiteľmi?
Program: VEGA 1/0546/22
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Linda Petijová, PhD.
Doba trvania: 01.01.2022 – 31.12.2025
Viac: Projekt je zameraný na zistenie analógie a prípadných komunikačných kanálov medzi endofytickými hubami a ich hostiteľskými rastlinami z rodu Hypericum v súvislosti s biosyntézou antrachinónov. Zámer vychádza z predpokladu, že analogické sekvencie biosyntetických génov sú prítomné v hostiteľských rastlinách aj endofytoch z nich izolovaných. Východiskom pre štúdium budú dosiaľ známe fungálne biosyntetické génové klastre (BGCs) antrachinónov a kandidátne gény biosyntézy hypericínu v Hypericum spp. Zároveň predpokladáme, že súčasťou fungálnych BGCs bude gén kódujúci CYP450 monooxygenázu, ktorá zodpovedá za dimerizáciu medziproduktov biosyntetickej dráhy antrachinónov.
Názov projektu: Nové antrachinóny prírodného pôvodu pre biomedicínske aplikácie
Program: APVV-18-0125
Zodpovedný riešiteľ: prof. RNDr. Eva Čellárová, DrSc.
Doba trvania: 01.07.2019 – 30.06.2023
Viac: Projekt je zameraný na štúdium vybraných antrachinónových derivátov v rode Hypericum a v endofytických hubách izolovaných z rastlín rodu Hypericum, kde predstavujú medziprodukty biosyntetickej dráhy hypericínu, resp. intermediáty polyketidových biosyntetických dráh. Cieľom projektu je charakterizácia nových zdrojov pre produkciu antrachinónov, identifikácia miRNA s potenciálnou regulačnou úlohou v ich biosyntéze, vypracovanie vhodného transformačného systému pre validáciu kandidátnych biosyntetických génov, genotoxická analýza a determinácia protinádorového potenciálu antrachinónových derivátov.
Názov projektu: Génové klastre biosyntetických génov skyrínu v endofytických hubách: kľúč k objasneniu biosyntézy hypericínu v rode Hypericum?
Program: VEGA 1/0013/19
Zodpovedný riešiteľ: prof. RNDr. Eva Čellárová, DrSc.
Doba trvania: 01.01.2019 – 31.12.2022
Viac: Projekt je zameraný na štúdium regulácie biosyntézy bioaktívneho fotodynamického pigmentu hypericínu v rode Hypericum. Zámer projektu vychádza z predpokladu, že kľúčovým intermediátom biosyntézy hypericínu je antrachinón skyrín, ktorého prítomnosť v rastlinnej ríši bola dosiaľ potvrdená len v hypericín-produkujúcich druhoch rodu Hypericum, ale často sa nachádza v endofytických hubách vrátane tých, ktoré sme v súčasnosti izolovali z viacerých druhov rodu Hypericum. Východiskom pre štúdium budú gény génového klastra pre biosyntézu skyrínu z Cyanodermella asteris, ich homológy a sekvencie, ktoré boli v rámci predchádzajúceho projektu identifikované ako diferenciálne exprimované v transkriptómoch pletív s akumuláciou hypericínu. Predpokladáme, že korelačná analýza medzi genómom/transkriptómom a metabolómom endofytov a hostiteľov prinesie nové poznatky o regulácii biosyntézy hypericínu a o vzájomnej komunikácii medzi hostiteľom a endofytom počas biosyntézy významných bioaktívnych polyketidov v rode Hypericum.
